Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRPS1Q9UHF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPS1Q9UHF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPS1Q9UHF7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPS1Q9UHF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPS1Q9UHF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPS1Q9UHF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPS1Q9UHF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPS1Q9UHF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms