Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7AQ9UBW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS7AQ9UBW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7AQ9UBW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7AQ9UBW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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