Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM8A1Q9UBU6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM8A1Q9UBU6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM8A1Q9UBU6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM8A1Q9UBU6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM8A1Q9UBU6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM8A1Q9UBU6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms