Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
MBD5Q9P267 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
MBD5Q9P267 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
MBD5Q9P267 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.77■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
MBD5Q9P267 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
MBD5Q9P267 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
MBD5Q9P267 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
MBD5Q9P267 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.54■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
MBD5Q9P267 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
MBD5Q9P267 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
MBD5Q9P267 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms