Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLRT3Q9NZU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLRT3Q9NZU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLRT3Q9NZU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FLRT3Q9NZU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms