Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLRF1Q9NZS2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLRF1Q9NZS2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLRF1Q9NZS2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLRF1Q9NZS2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLRF1Q9NZS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLRF1Q9NZS2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLRF1Q9NZS2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms