Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ6

COQ3, Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ3Q9NZJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ3Q9NZJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COQ3Q9NZJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COQ3Q9NZJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COQ3Q9NZJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COQ3Q9NZJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COQ3Q9NZJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COQ3Q9NZJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms