Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYX4

CALY, Neuron-specific vesicular protein calcyon, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALYQ9NYX4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CALYQ9NYX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALYQ9NYX4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALYQ9NYX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALYQ9NYX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALYQ9NYX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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