Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF7

DCAF16, DDB1- and CUL4-associated factor 16, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF16Q9NXF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCAF16Q9NXF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCAF16Q9NXF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF16Q9NXF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF16Q9NXF7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF16Q9NXF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms