Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK1IP1Q9NWT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAK1IP1Q9NWT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAK1IP1Q9NWT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAK1IP1Q9NWT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAK1IP1Q9NWT1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAK1IP1Q9NWT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAK1IP1Q9NWT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAK1IP1Q9NWT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAK1IP1Q9NWT1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAK1IP1Q9NWT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms