Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3BQ9NW08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3BQ9NW08 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3BQ9NW08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3BQ9NW08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3BQ9NW08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms