Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXD2Q9NVH0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXD2Q9NVH0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXD2Q9NVH0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXD2Q9NVH0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXD2Q9NVH0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms