Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM100Q9NV29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM100Q9NV29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM100Q9NV29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM100Q9NV29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM100Q9NV29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM100Q9NV29 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms