Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYRM2Q9NU23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYRM2Q9NU23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYRM2Q9NU23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYRM2Q9NU23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYRM2Q9NU23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms