Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HELLSQ9NRZ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELLSQ9NRZ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELLSQ9NRZ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
HELLSQ9NRZ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
HELLSQ9NRZ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELLSQ9NRZ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HELLSQ9NRZ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HELLSQ9NRZ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms