Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERINC1Q9NRX5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERINC1Q9NRX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERINC1Q9NRX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SERINC1Q9NRX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERINC1Q9NRX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERINC1Q9NRX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms