Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCUBE2Q9NQ36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCUBE2Q9NQ36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCUBE2Q9NQ36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCUBE2Q9NQ36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCUBE2Q9NQ36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCUBE2Q9NQ36 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms