Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCM1Q9NP62 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM1Q9NP62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCM1Q9NP62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM1Q9NP62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms