Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM27Q9HBJ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM27Q9HBJ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM27Q9HBJ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM27Q9HBJ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM27Q9HBJ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM27Q9HBJ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM27Q9HBJ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms