Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEBOXQ9HB31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEBOXQ9HB31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEBOXQ9HB31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEBOXQ9HB31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEBOXQ9HB31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEBOXQ9HB31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms