Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNCQ9H7C4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNCQ9H7C4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNCQ9H7C4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNCQ9H7C4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNCQ9H7C4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNCQ9H7C4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNCQ9H7C4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNCQ9H7C4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNCQ9H7C4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms