Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMYD3Q9H7B4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMYD3Q9H7B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD3Q9H7B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD3Q9H7B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMYD3Q9H7B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD3Q9H7B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms