Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX3Q9H6A9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNX3Q9H6A9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX3Q9H6A9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX3Q9H6A9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms