Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SENP3Q9H4L4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SENP3Q9H4L4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SENP3Q9H4L4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SENP3Q9H4L4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SENP3Q9H4L4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SENP3Q9H4L4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SENP3Q9H4L4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SENP3Q9H4L4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SENP3Q9H4L4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SENP3Q9H4L4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms