Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPNS1Q9H2V7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPNS1Q9H2V7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPNS1Q9H2V7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPNS1Q9H2V7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPNS1Q9H2V7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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