Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC68Q9H2F9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC68Q9H2F9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC68Q9H2F9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC68Q9H2F9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms