Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRL3Q9H299 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRL3Q9H299 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRL3Q9H299 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BGRL3Q9H299 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BGRL3Q9H299 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3Q9H299 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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