Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG10Q9H0Y0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG10Q9H0Y0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG10Q9H0Y0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG10Q9H0Y0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG10Q9H0Y0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG10Q9H0Y0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG10Q9H0Y0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG10Q9H0Y0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG10Q9H0Y0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms