Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A4Q9H015 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A4Q9H015 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A4Q9H015 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A4Q9H015 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A4Q9H015 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms