Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NACA2Q9H009 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NACA2Q9H009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NACA2Q9H009 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NACA2Q9H009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NACA2Q9H009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NACA2Q9H009 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NACA2Q9H009 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NACA2Q9H009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NACA2Q9H009 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NACA2Q9H009 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NACA2Q9H009 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms