Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NYXQ9GZU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NYXQ9GZU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NYXQ9GZU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NYXQ9GZU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NYXQ9GZU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NYXQ9GZU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NYXQ9GZU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NYXQ9GZU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NYXQ9GZU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NYXQ9GZU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms