Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPR88Q9GZN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPR88Q9GZN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPR88Q9GZN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPR88Q9GZN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPR88Q9GZN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms