Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2J2Q9GZM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2J2Q9GZM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2J2Q9GZM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J2Q9GZM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2J2Q9GZM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2J2Q9GZM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2J2Q9GZM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms