Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL4Q9C0H6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL4Q9C0H6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL4Q9C0H6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KLHL4Q9C0H6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL4Q9C0H6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL4Q9C0H6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL4Q9C0H6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL4Q9C0H6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL4Q9C0H6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL4Q9C0H6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms