Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHACTR1Q9C0D0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR1Q9C0D0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHACTR1Q9C0D0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR1Q9C0D0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR1Q9C0D0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR1Q9C0D0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHACTR1Q9C0D0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms