Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 319.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 216.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 CA8-202ENST00000524872 1825 ntTSL 1 (best)21.32■■□□□ 14e-8■■■■■ 35.3
FTOQ9C0B1 CA8-204ENST00000529918 1697 ntTSL 216.4■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 35.3
FTOQ9C0B1 CA8-201ENST00000317995 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 35.3
FTOQ9C0B1 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 221.85■■□□□ 1.091e-11■■■■■ 35.3
FTOQ9C0B1 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 521.04■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 218.42■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 35.2
FTOQ9C0B1 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.216e-27■■■■■ 35.1
FTOQ9C0B1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 34.9
FTOQ9C0B1 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 313.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 34.9
FTOQ9C0B1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.672e-8■■■■■ 34.6
FTOQ9C0B1 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 34.5
FTOQ9C0B1 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 34.5
FTOQ9C0B1 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 34.4
FTOQ9C0B1 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 337.95■■■■□ 3.679e-12■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 426.12■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.497e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 34.3
FTOQ9C0B1 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 322.06■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 34.2
FTOQ9C0B1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.421e-8■■■■■ 34.1
FTOQ9C0B1 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.327e-8■■■■■ 33.7
FTOQ9C0B1 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 33.7
FTOQ9C0B1 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.715e-9■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.365e-9■■■■■ 33.5
FTOQ9C0B1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.81e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 GNPNAT1-205ENST00000557604 785 ntTSL 324.8■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-206ENST00000455773 959 ntTSL 520.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-203ENST00000429258 646 ntTSL 320.24■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 C15orf39-203ENST00000562637 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 318.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 C15orf39-204ENST00000563905 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.95■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-207ENST00000467016 296 ntTSL 214.95□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 CDC123-205ENST00000442050 564 ntTSL 56.37□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 33.4
FTOQ9C0B1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 33.3
FTOQ9C0B1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 33.3
FTOQ9C0B1 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 33.3
FTOQ9C0B1 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 33.3
FTOQ9C0B1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 33.2
FTOQ9C0B1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 33.2
FTOQ9C0B1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 33.2
FTOQ9C0B1 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 33.2
FTOQ9C0B1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.635e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.475e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 226.4■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ST20-MTHFS-202ENST00000494999 632 ntTSL 325.65■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 520.09■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-202ENST00000586111 390 ntTSL 319.71■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 318.85■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 MTHFS-204ENST00000560919 470 ntTSL 218.48■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 318.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-204ENST00000379101 2268 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 216.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -05e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 SCNN1D-208ENST00000470022 645 ntTSL 313.47□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 33.1
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