Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NMES1Q9C002 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMES1Q9C002 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMES1Q9C002 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NMES1Q9C002 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NMES1Q9C002 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMES1Q9C002 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms