Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TM6SF1Q9BZW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
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