Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TM6SF1Q9BZW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM6SF1Q9BZW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TM6SF1Q9BZW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TM6SF1Q9BZW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TM6SF1Q9BZW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TM6SF1Q9BZW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TM6SF1Q9BZW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TM6SF1Q9BZW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341.5 ms