Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFIH1Q9BYX4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFIH1Q9BYX4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFIH1Q9BYX4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFIH1Q9BYX4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFIH1Q9BYX4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFIH1Q9BYX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFIH1Q9BYX4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFIH1Q9BYX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFIH1Q9BYX4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIH1Q9BYX4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms