Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP2-1Q9BYU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP2-1Q9BYU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms