Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL1Q9BYD6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL1Q9BYD6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL1Q9BYD6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL1Q9BYD6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL1Q9BYD6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL1Q9BYD6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL1Q9BYD6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL1Q9BYD6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms