Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSBP4Q9BWG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP4Q9BWG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP4Q9BWG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP4Q9BWG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP4Q9BWG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms