Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
REPIN1Q9BWE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REPIN1Q9BWE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REPIN1Q9BWE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REPIN1Q9BWE0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REPIN1Q9BWE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms