Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDC1Q9BTX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDC1Q9BTX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDC1Q9BTX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC1Q9BTX1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC1Q9BTX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC1Q9BTX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms