Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC1Q9BTT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC1Q9BTT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC1Q9BTT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC1Q9BTT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC1Q9BTT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC1Q9BTT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC1Q9BTT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC1Q9BTT6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC1Q9BTT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms