Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RBM42Q9BTD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RBM42Q9BTD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RBM42Q9BTD8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RBM42Q9BTD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RBM42Q9BTD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RBM42Q9BTD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
RBM42Q9BTD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RBM42Q9BTD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RBM42Q9BTD8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RBM42Q9BTD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RBM42Q9BTD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RBM42Q9BTD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RBM42Q9BTD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms