Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RETNLBQ9BQ08 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RETNLBQ9BQ08 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RETNLBQ9BQ08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms