Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF6BQ99941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF6BQ99941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF6BQ99941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6BQ99941 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF6BQ99941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF6BQ99941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6BQ99941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms