Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MIPEPQ99797 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MIPEPQ99797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIPEPQ99797 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIPEPQ99797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MIPEPQ99797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MIPEPQ99797 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MIPEPQ99797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms