Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5SQ99766 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5SQ99766 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5SQ99766 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5SQ99766 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5SQ99766 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5SQ99766 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5SQ99766 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5SQ99766 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5SQ99766 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5SQ99766 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5SQ99766 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5SQ99766 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5SQ99766 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5SQ99766 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5SQ99766 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms